日本長達18年的可燃冰開發計劃分為三個階段。

　　從2001年到2008年，是該計劃的第一階段，主要對可燃冰的探測技術、分解生成、生產技術及環境影響評估等進行基礎研究。

　　該階段取得了一系列的具體成果，包括確認在日本東部從靜岡縣至和歌山縣南海海域盆地發現了具有開發價值的高濃度可燃冰聚集帶。根據調查結果，該海域存在的可燃冰相當于日本全國年度天然氣消費量的13.5倍。

　　這一階段的成果還包括：確立了利用探查地震的方法來測定可燃冰存在的手段；開始利用數學概率計算該海域的可燃冰原始儲藏量；開發出日本獨創的從可燃冰層生產甲烷氣體的預測模擬系統。通過大量的實驗和科學數據，證實了“減壓法”是有效的發掘可燃冰的生產手段。

　　從2009年至2015年，是第二階段，其中最主要的活動是在日本周邊海域進行兩次生產試驗。

　　此階段的具體目標包括：通過生產試驗對技術進行驗證，并對今后的商業生產提出技術課題；掌握日本周邊海域的可燃冰儲藏具體狀況；總結出進行環境評測的手段；從安全角度和經濟角度對可燃冰的開發可能性進行總結。

　　預計鉆探和生產試驗的費用將達到170億日元(約合2.2億美元)。日本政府在2011財年預算中已為此計劃撥款89億日元(約合1.15億美元)。

　　2016年至2018年是第三階段，主要是基于前兩個階段的研究和試驗結果，對可燃冰的商業生產價值、開采效益和環境影響做出最終的綜合評價。如果鉆探和生產試驗獲得了成功，日本有望從2018年開始對可燃冰實現商業開采。