處理和利用生物質能不單只用來當燃料使用，也有其他用途，例如玉米。
利用植物的生質能電池
生質柴油的加油站低技術處理包括:[3]
堆肥 (調整和增肥土壤)
厭氧消化 (使生物質能腐爛以生產沼氣或將污泥轉成肥料)
發酵和蒸餾 (都用來制造乙醇)
生物質能更高技術的處理包括:
高溫裂解 (在空氣不足或缺乏空氣的狀態下加熱有機廢棄物以制造像是瓦斯或是煤炭等易燃物)
加氫氣化 (生產甲烷和乙烷)
氫化 (在高溫高壓下用一氧化碳和蒸氣將生物質能轉化為石油)
破壞性蒸餾 (用高纖維有機廢棄物中生產甲醇)
酸水解 (用廢木材生產可蒸餾的糖類)
燃燒生物質能或是其所生產的燃料，可以用來生產熱能或是電能。
生物質能的其他用途，除燃料和堆肥包括:
建材
生物可降解塑膠和紙張(用纖維素)
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