臭氧作為氣體殺菌劑，依靠其氧化性產生對病毒，細菌及霉菌等微生物的較強殺滅作用。同任何消毒劑一樣，對動物與人造成一定的生理反應甚至損害，但臭氧比常用消毒劑要小的多，防保也容易得多，所以利用臭氧殺菌消毒的方式慢慢被越來越多的工業或者企業所接受。
臭氧能夠有效殺死包括藻類在內的微生物，因為它具有強大的氧化能力，可以殺滅細胞膜。臭氧還能夠滅活某些浮游動物，包括某些移動生物。采用臭氧氧化設備不僅可以有效地去除水中的有機物，而且反應速度快，設備體積小。尤其是水中含有酚類化合物時，臭氧處理可以去除酚所產生的惡臭。此外，臭氧還是一種有效的消毒劑，殺菌效果好、速度快，而且對消滅病毒也很有效。
在水處置實際中藻類問題廣泛存在，藻類含量高會影響混凝和積淀，增長混凝劑量；梗塞濾池，收縮濾池過濾周期；致臭并發生藻毒素，和氯感化構成氯化消毒副產品，低落飲用水平安性。在水處置中使用臭氧產生器便可以處理這些問題。
臭氧發生器處置感化之一是溶裂藻細胞，二是殺藻，使死亡的藻類易于被后續工藝去除。臭氧產生器可作為除藻的一種預處置法子，它和通例處置及別的技能共同使用是處置富養分化水源水藻類問題的使用方法之一。藻毒素正成為藻類凈化問題的另外一重點，在必要的前提下臭氧產生器可有效去除某些藻毒素，去除率取決于臭氧產生器投加量，其次取決于原水水質(藻毒素范例、有機物性子及濃度、堿度等)。
在使用臭氧發生器測試結果表明，操縱臭氧產生器處置百度30分鐘含40－50萬個/ml單胞藻及原活潑物的海水后，再用顯微鏡察看發現其所有的原活潑動物呈爆炸性死亡，把顛末水處置臭氧產生器處置的海水繼承培育兩個禮拜今后查驗測試仍未發現任何生物，且水質清徹通明，取赤潮海水進行30分鐘臭氧處置后赤色赤潮海水被氧化變成紅色通明，水中夜光蟲全數被殺死且呈破壞狀。
