無水生態廁所時通過特殊馴化的微生物對糞便進行處理。糞便進入生態廁所核心裝置，通過攪拌被微生物包裹住，在攪拌充氧的條件下被分解成二氧化碳、水蒸氣、和氨氣等氣體。因糞便主要成分是碳水化合物，分解會非常徹底，少量鈣、鐵、鉀等剩余物可作為農業有機化肥，一般半年清理一次，可創造經濟價值。生態廁所下面不要挖化糞池，也不需要通過污水管道將糞便污水送到污水處理廠處理一年才更換菌種及填料一次，極少殘雜物可作為有機肥料用于綠化。該廁所廣泛運用于各類公共場所、旅游景區、海濱、小區、大會集會場所、展示會、高速公路、停車場、地下工程、學校、軍隊、運動場、高爾夫球場、建筑工地、商業街、集貿市場、進港船舶、臨時性工地、堆場、公園、車站、野營地以及運動競賽等各種戶外的臨時性場所，移動廁所無水生態廁所環保的關鍵，還在于它便后免沖水，可節約大量的水源。無水生態廁所運用先進的固液分離技術，使大小便分離，通過研制的廁所專用制劑FDZJ，對小便進行殺菌、消毒、除臭、凈化后，循環使用，沖洗大便，得以免水。
     除此之外，帶有堆肥功能的無水生態廁所能有效安全地回收人排泄物中植物所需的營養物質，具有“有機肥生產工廠”的美譽。使用無水生態廁所每年人均可回收40KG左右的優質有機肥，一個公廁（15蹲位）每年可回收10T左右。如果無水生態廁所能普及，每年將可回收大量的有機肥，將對農業生產向著自然生態發展起到積極地推動作用。